Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms