Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef6A2A8M8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef6A2A8M8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef6A2A8M8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef6A2A8M8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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