Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms