Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms