Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms