Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdcd6ipQ9WU78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdcd6ipQ9WU78 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd6ipQ9WU78 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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