Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms