Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam50bQ9WTJ8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms