Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms