Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamc3Q9R0B6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamc3Q9R0B6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms