Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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