Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms