Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms