Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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