Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Smg9Q9DB90 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Smg9Q9DB90 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Smg9Q9DB90 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Smg9Q9DB90 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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