Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms