Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc52a2Q9D8F3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc52a2Q9D8F3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms