Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccdc7Q9D541 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7Q9D541 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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