Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms