Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmbr1lQ9D1E5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms