Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms