Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exosc7Q9D0M0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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