Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms