Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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