Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Exo5Q9CXP9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exo5Q9CXP9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms