Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Filip1Q9CS72 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms