Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms