Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2a1Q99PM3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms