Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NsmfQ99NF2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms