Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac9Q99N13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms