Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms