Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp1b4Q99ME6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms