Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vmp1Q99KU0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Vmp1Q99KU0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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