Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Afg3l1Q920A7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Afg3l1Q920A7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Afg3l1Q920A7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Afg3l1Q920A7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Afg3l1Q920A7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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