Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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