Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf4Q8R368 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms