Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms