Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pramef8Q8CE24 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms