Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc9Q8CDN9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Lrrc9Q8CDN9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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Lrrc9Q8CDN9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc9Q8CDN9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms