Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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