Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms