Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms