Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 576.7 ms