Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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