Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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C030005K15RikQ8BQN9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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C030005K15RikQ8BQN9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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C030005K15RikQ8BQN9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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C030005K15RikQ8BQN9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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