Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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