Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms