Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms