Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc1Q80VQ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms