Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms